甘肃省第二人民医院前身为兰州铁路中心医院，建院已40多年，是一所集医疗、教学、科研、预防为一体的综合性国家三级医院。医院编制床位620张，拥有固定资产近亿元；设有27个临床科室，13个职能科室，一所分院和7个社区医疗服务站，有4个临床教研室；承担着兰州大学医学院校的临床教学任务。
甘肃省第二人民医院现有职工763人，其中卫生技术人员585人，有高级职称91人，中级职称250人；拥有核磁共振、螺旋CT、血管造影机、全数字化彩超等先进设备。医院功能完备，学科齐全，服务设施完善，心血管内科、消化内科、神经外科、介入放射科为医院重点发展的学科。介入技术、消化内窥镜等微创技术处于省内领先水平，是甘肃省、兰州市职工基本医疗保险定点医疗机构，也是省紧急医疗救援中心的主力分站之一。
2004年2月28日，甘肃省第二人民医院移交由甘肃省政府管理，更名为甘肃省铁路中心医院；2005年10月1日，原铁道部第一勘测设计院职工医院又并入该医院。医院移交地方管理以来，在转制过程中受到了生存与发展的种种压力和挑战，遇到了前所未有的困难。在省政府和省卫生厅等有关部门及兰州铁路局的密切关怀支持下，全院职工积极转变观念，努力拼搏，励精图治，内强素质，外树形象，主动适应市场，使医疗服务水平有了新的提高，社会效益和经济效益有了一定的增长，综合实力得到了进一步的增强，在改革发展的道路上迈出了可喜的一步。
经省人民政府同意，兰州铁路中心医院更名为甘肃省第二人民医院；该院定性为全民所有制事业单位，是政府举办的非营利性医疗机构，按照市场化机制运作，医疗服务价格执行政府指导价。省卫生厅对医院人事、党务、行政进行直属管理，同时对国有资产进行监督，对业务进行指导。